Жакында жарыяланган изилдөөМикробиомБатыш Африканын Сьерра-Леонеде чогултулган 846 жапайы майда сүт эмүүчүлөргө, анын ичинде жарганаттарга, кемирүүчүлөргө жана чымын-чиркейлерге вирустук метагеномикалык анализ жүргүзгөн. Изилдөөдө сүт эмүүчүлөр менен байланышкан 39 РНК вирусу аныкталган, алардын ичинен 26сы жаңы жана 13ү мурда белгилүү болгон вирустар. Алардын ичинен Paramyxoviridae тукуму эң жогорку ар түрдүүлүктү көрсөтсө, кемирүүчүлөрдө вирустук түрлөрдүн саны эң көп болгон (n = 26).
Зооноздук тобокелдикти баалоо үч белгилүү зооноздук вирусту — энцефаломиокардит вирусун, Ласса вирусун жана Рокахепевирус sp. — ошондой эле жайылып кетүү коркунучу бар үч вирусту: Мелиан вирусун, кемирүүчүлөрдүн гепатит вирусун жана Хуннивирус Аны аныктады. Белгилей кетчү нерсе, жаңы аныкталган вирустардын ичинен Bat ledantevirus 2 адамга жуккан Le Dantec вирусуна эң жакын филогенетикалык байланышты көрсөттү. Серологиялык анализ жергиликтүү тургундардын 2,8%ында бул вируска каршы нейтралдаштыруучу антителолорду аныктады, бул мурда адамдарда аныкталган эместигин көрсөтүп турат.
Бул ачылыштар Батыш Африкада кемирүүчүлөр басымдуулук кылган олуттуу вирустук резервуардын бар экендигин баса белгилеп, адам менен жаныбарлардын ортосундагы интеграцияланган байкоо жүргүзүү стратегияларынын маанилүүлүгүн баса белгилейт. Метагеномдук скринингди серологиялык валидация менен айкалыштыруу зооноздук жана жайылып кетүү мүмкүнчүлүгү бар вирустарды аныктоо үчүн бекем алкакты камсыз кылат.
Акыркы он жылдыкта адамдарда пайда болгон жугуштуу оорулардын 60% дан ашыгы жаныбарлардын суу сактагычтарынан келип чыккан, жарганаттар, кемирүүчүлөр жана чычкандар зооноздук вирустардын негизги алып жүрүүчүлөрү катары таанылган. Африка зооноздук оорулардын очогу катары кеңири таанылган. Мисалы, Сьерра-Леонеде 2014-2016-жылдардагы Эбола эпидемиясы учурунда 28 000ден ашык учур катталган.
Бул аймакта зооноздук оорулардын олуттуу жүгүнө карабастан, жапайы майда сүт эмүүчүлөрдөгү вирустардын ар түрдүүлүгү жана таралышы жетиштүү деңгээлде мүнөздөлбөгөн бойдон калууда. Бул кемчиликти жоюу үчүн изилдөөчүлөр 2018-2023-жылдар аралыгында Сьерра-Леонедеги үч жерде кармалган 846 жапайы майда сүт эмүүчүнүн вирусомдук анализин жүргүзүшкөн. Изилдөөнүн максаты вирустук ар түрдүүлүктү мүнөздөө, түрлөр аралык жугуу мүмкүнчүлүгү бар талапкерлерди аныктоо, зооноздук тобокелдикти баалоо жана жаңы пайда болгон жугуштуу оорулар боюнча эрте эскертүү системаларын колдоо үчүн далилдерди түзүү болгон.
Негизги ыкмалар
Изилдөөдө вирустук метагеномиканын комплекстүү жумуш агымы колдонулган:
- Үлгү иштетүү:Жүрөк, боор, көк боор, өпкө жана бөйрөк ткандары чогултулуп, бириктирилип, гомогендештирилип, жалпы РНК экстракциясына дуушар болгон.
- Ырааттуулукту сактоо жана чогултуу:Рибосомалык РНКнын азайышы китепкананы куруудан мурун жүргүзүлүп, андан кийин Illumina NovaSeq 6000 платформасын колдонуу менен жогорку өндүрүмдүүлүктөгү секвенирлөө жүргүзүлдү. Вирустук контигдер жаңыдан чогултулган.
- Вирусту аныктоо:Вирустар РНКга көз каранды РНК полимераза (RdRp) генинин дал келүүсүнүн негизинде аныкталган. Бактериялык, грибоктук жана өсүмдүк вирустарын кошпогондо, омурткалуу жаныбарлар менен байланышкан вирустар гана сакталып калган.
- Биоинформатика анализи:Филогенетикалык реконструкция, рекомбинациялык анализ, түрлөр аралык берүү тармагын моделдөө жана зооноздук тобокелдикти баалоо жүргүзүлдү.
- Серологиялык валидация:Bat ledantevirus 2 үчүн VSV негизиндеги псевдовирусту нейтралдаштыруу анализи иштелип чыккан. Нейтралдаштыруучу антителолор адамдын кан сары суусунун 2,8%ында аныкталган, бул зооноздук жугуунун потенциалдуу далилин берет.
ИзилдөөЖыйынтыктар
1. Вирустук ачылыш жана ар түрдүүлүк
Бул изилдөөдө Сьерра-Леонеде чогултулган 846 жапайы жаныбарларга, анын ичинде кемирүүчүлөргө, жарганаттарга жана чымын-чиркейлерге транскриптомдук секвенирлөө анализи жүргүзүлдү. РНКга көз каранды РНК-полимераза (RdRp) генинин толук ырааттуулугуна таянып, сүт эмүүчүлөр менен байланышкан 39 РНК вирусу аныкталды, алардын ичинен мурда белгилүү болгон 13 вирус жана 26 жаңы вирус бар.
Вирустук курамы боюнча, Paramyxoviridae тукуму үч кожоюн түркүмүнүн баарында эң жогорку ар түрдүүлүктү көрсөттү, андан кийин Astroviridae жана Picornaviridae турат. Кожоюндун таралышына келсек, кемирүүчүлөр вирустук ар түрдүүлүктүн эң чоң салымын кошуп, жалпысынан 26 вирус түрүн камтыган, бул алардын аймактагы вирустук ар түрдүүлүктүн резервуары катары көрүнүктүү ролун көрсөтүп турат.
2. Зооноздук коркунуч
Зооноздук тобокелдикти баалоо үч белгилүү зооноздук вирусту аныктады: энцефаломиокардит вирусу, Ласса вирусу жана Рокагепевирус түрлөрү. Мындан тышкары, үч вирус — Мелиан вирусу, кемирүүчүлөрдүн гепатит вирусу жана Хуннивирус А — жайылып кетүү коркунучу бар экени аныкталды.
Жаңы ачылган 26 вирустун ичинен төртөө филогенетикалык жана геномдук мүнөздөмөлөргө негизделген жогорку зооноздук потенциалга ээ деп болжолдонгон. Белгилей кетчү нерсе, Bat ledantevirus 2 белгилүү адамга жуккан Le Dantec вирусуна эң жакын филогенетикалык байланышты көрсөткөн.
Кийинки серологиялык изилдөөлөр бул жыйынтыкты дагы бир жолу тастыктады, анткени жергиликтүү тургундардын кан сары сууларынын 2,8%ында Bat ledantevirus 2ге каршы нейтралдаштыруучу антителолор табылган. Бул жыйынтык таанылбаган же симптомсуз инфекциялар адам популяциясында мурунтан эле болгон болушу мүмкүн экенин көрсөтүп турат, бул зооноздук жугуу жолу бар экенин, бирок мурда аныкталбаганын көрсөтүп турат.
3. Түрлөрдүн ортосундагы жугуу динамикасы
Түрлөрдүн ортосунда жугуу анализи кемирүүчүлөр вирус бөлүшүү тармагында борбордук орунду ээлей турганын жана кожоюн түрлөрдүн ортосунда вирус алмашууну жеңилдеткен негизги түйүндөр катары иштээрин көрсөттү. Түрлөрдүн ортосунда жугуу мүмкүнчүлүгү бар жалпысынан 15 вирус аныкталган.
Кайчылаш тартиптеги жугуу үлгүлөрүн андан ары талдоо вирустук бөлүшүү бир таксономиялык тартиптеги кожоюндардын ортосунда көбүрөөк кездешкенин көрсөттү, бул кожоюндун байланышы жугуу динамикасында маанилүү ролду ойной тургандыгын көрсөтүп турат. Ал эми жарганаттар кайчылаш тартиптеги жугуу үчүн салыштырмалуу төмөн жөндөмдүүлүктү көрсөтүштү.
Маанилүүсү, айрым вирустарда кожоюндун ареалынын кеңейгенинин далилдери байкалган. Мисалы, мурда рыцарларга гана мүнөздүү деп эсептелген Мелиан вирусу бул изилдөөдө кемирүүчүлөрдө да аныкталган, бул кожоюндун адаптациясынын өзгөрүшүн жана кеңири жугуу коркунучунун жогорулаганын көрсөтүп турат.
Тыянактар жана коомдук саламаттыкты сактоого тийгизген таасири
- Жапайы майда сүт эмүүчүлөрдөгү вирустардын ар түрдүүлүгүнүн жогорулугу:26 жаңы түрдү кошо алганда, 39 РНК вирусунун ачылышы аймакта чоң вирус резервуарын ачып, биринчи жолу жогорку зооноздук потенциалга ээ жаңы вирустар (мисалы, Bat ledantevirus 2) жөнүндө кабарлады.
- Кемирүүчүлөрдү байкоонун артыкчылыктуу объектилери катары:Кемирүүчүлөр вирустун жугушунун негизги борборлору катары кызмат кылышат жана вирустук ар түрдүүлүктүн эң жогорку деңгээлин алып жүрүшөт, бул эң чоң жайылуу коркунучун билдирет.
- Интеграцияланган байкоо жүргүзүү стратегияларынын зарылдыгы:Бул ачылыштар кемирүүчүлөрдү активдүү байкоо программаларында артыкчылыктуу деп эсептөөнү жана адам менен жапайы жаратылыштын ортосундагы чек араларда метагеномиканы, серологияны жана экологиялык мониторингди айкалыштырган интеграцияланган ыкмаларды ишке ашырууну колдойт.
Жалпысынан алганда, бул изилдөө жаңы пайда болгон зооноздук оорулардын эрте эскертүү системаларын жана тобокелдиктерди баалоо алкактарын колдоо үчүн маанилүү далилдерди келтирип, жогорку тобокелдик аймактарында проактивдүү байкоо жүргүзүүнүн маанилүүлүгүн баса белгилейт.
Продукция жөнүндө маалымат
Жарыяланган убактысы: 2026-жылдын 23-марты