Чжэцзян провинциясындагы Brucella abortus бактериясынын биринчи жолу геномго негизделген толук көзөмөлдөө анализи – Macro & Micro-Test компаниясынын биоинформатика тобу биргелешкен басылмага салым кошту

—— Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test жана China CDC биргелешкен изилдөөсү Frontiers in Cellular and Infection Microbiology журналында жарыяланган.

Изилдөөгө сереп

2026-жылдын май айында Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) журналы Чжэцзян провинциясынын Ооруларды көзөмөлдөө жана алдын алуу борборунун (Чжэцзян CDC) жетекчилиги астында Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd компаниясынын биоинформатика тобу жана Улуттук жугуштуу ооруларды көзөмөлдөө жана алдын алуу институтунун (Кытай CDC) биргелешип авторлошкон макаласын жарыялаган. Изилдөөнүн аталышы:
«Кытайдын Чжэцзян провинциясындагы жети Brucella abortus штаммын идентификациялоо жана филогенетикалык анализ».
Бруцелла абортус

Бул изилдөө Кытайдын Чжэцзян провинциясындагы Brucella abortus (B. abortus) бактериясынын биринчи системалуу, бүтүндөй геномго негизделген филогенетикалык көзөмөлдөө анализин билдирет. Топ 2015-жылдан 2025-жылга чейин чогултулган жети изолятты (Цзиньхуа, Цюйчжоу жана Нинбодон алынган төрт адам тектүү жана үч бодо мал тектүү штаммдарды) талдап чыккан. Жыйынтыктар Кытайдын чыгышындагы атиптик түштүк эпидемиялык аймагындагы бул "түндүк доминант түрдүн" келип чыгышы жана жугуу жолдору жөнүндө геномдук далилдерди берет.

 

Өбөлгө жана мааниге ээ

 

Бруцеллез - Brucella тукумундагы бактериялар козгогон зооноздук оору. Brucella abortus негизинен бодо малды жуктурат, бирок адамдарда да ооруну козгошу мүмкүн. Кытайда бруцеллез географиялык жактан айырмачылыкты көрсөтөт: эң жогорку көрсөткүч түндүк провинцияларда (мисалы, Ички Монголия, Шаньси, Хэйлунцзян) байкалат. Ал эми Чжэцзянды кошо алганда, түштүк провинцияларда тарыхый жактан Brucella melitensis басымдуулук кылып келген, B. abortus учурлары өтө аз катталган. Бул аймактык айырмачылык Чжэцзяндагы B. abortusтун генетикалык мүнөздөмөсүн жана булагын издөөнү коомдук саламаттыкты сактоонун негизги артыкчылыгы кылат.

 

Методдор жана негизги жыйынтыктар

Изилдөө тобу молекулярдык биологияны жана биоинформатиканы айкалыштырган көп багыттуу стратегияны кабыл алды:

1.Патогенди аныктоо жана негизги типтештирүү

BCSP-31 генинин ПТР жана AMOS-ПТР жети изоляттын баары B. abortus экенин тастыктады.

Тогуз үй чарбачылыгы генине негизделген Multilocus секвенциялык типтөө (MLST) бардык изоляттар ST2 секвенциялык түрүнө таандык экенин көрсөттү, бул Чжэцзян провинциясында кан айлануудагы B. abortus штаммдарынын арасында жогорку генетикалык бир тектүүлүктү көрсөтүп турат.
Патогенди аныктоо жана негизги типтештирүү

2.Геномдун толук мүнөздөмөсү

Геномдун толук секвенирлениши Illumina NovaSeq платформасында жүргүзүлдү. Орточо нуклеотиддик окшоштук (ANI) анализи Чжэцзян изоляттарынын B. abortus 544 эталондук штаммы менен 99,99% га чейин окшоштугу бар экенин көрсөттү.

Пан-геномдук анализ популяциянын жогорку деңгээлде сакталгандыгын көрсөттү: 3084 өзөк гени, ошондой эле 10 гана кабык гени аныкталган, ал эми жумшак өзөк же булут гени аныкталган эмес.

图片1

 

3.Вируленттүүлүк жана микробго каршы туруктуулук ген профилдери

Жалпысынан 68 вируленттүүлүккө байланыштуу факторлор болжолдонгон, алар LPS биосинтези, T4SS секреция системасы жана BvrR-BvrS эки компоненттүү жөнгө салуу системасы сыяктуу классикалык жолдорду камтыйт. Белгилей кетчү нерсе, бардык изоляттарда bmaA жана btaF адгезин гендери жок болгон. Каршылык көрсөтүү генинин анализи CARD маалымат базасынан mprF генин гана аныктаган, башка каршылык көрсөтүү детерминанттары аныкталган эмес.

Вируленттүүлүк4. Филогенетикалык реконструкция жана жугуунун трассировкасы

Өзөк-геномдун бир нуклеотиддик полиморфизми (cgSNP) анализи Чжэцзян изоляттарын глобалдык филогенетикалык даракта белгилүү бир орунга койду. Жыйынтыктар Чжэцзян штаммдары Россия, Монголия жана Кытайдын бир нече түндүк провинцияларынан (Нинся, Хэйлунцзян, Ички Монголия, Хэбэй, Ганьсу, Пекин) келген штаммдар менен бирге монофилдик топту түзөрүн көрсөттү. Бул топ андан ары үч башка субкладга бөлүнөт (1–3-клад), бул бир нече көз карандысыз интродукция окуяларын көрсөтүп турат.

Филогенетикалык реконструкция

Тыянактар ​​жана кесепеттер

 

Бул изилдөө Чжэцзян провинциясындагы B. abortusтун биринчи жогорку тактыктагы геномдук маалыматтар топтомун берет жана бир нече негизги тыянактарды берет:

 

  1. Клеar генетикалык фон– Чжэцзян провинциясында айланып жүргөн B. abortus штаммдары ST2ге кирет, геномдук жактан жогорку деңгээлде сакталган жана бодо малдын бруцеллез тукумунун типтүү түрүн билдирет.

 

2. Эвирегиондор аралык жугуу жыштыгы– Филогенетикалык анализ Чжэцзяндагы көз карандысыз эндемикалык тукумдун бар экендигин колдобойт. Тескерисинче, маалыматтар бул штаммдардын Түндүк Кытайдан келип чыкканын жана Орусия менен Монголиядан келген штаммдар менен жалпы эволюциялык фонго ээ болушу мүмкүн экенин күчтүү түрдө көрсөтүп турат. Үч субкладанын болушу бир нече өзүнчө интродукция окуяларын билдирет.

 

3. Коомдук саламаттыкты сактоого тийгизген таасири– Бул ачылыштар Чжэцзян сыяктуу салттуу түрдө эндемикалык эмес аймактарда да бруцеллезге геномдук көзөмөлдүн баалуулугун баса белгилейт. Учурдагы учурлардын саны аз болгону менен, cgSNP сыяктуу жогорку чечилиштеги куралдар импорттолгон эпидемиялардын булагын натыйжалуу байкап, провинциялар аралык мал ташуу менен байланышкан жугуу чынжырларын үзгүлтүккө учуратуу үчүн илимий далилдерди бере алат.

 

Бул иш Чжэцзян провинциясындагы изилдөөдөгү боштукту толтуруу менен бирге Янцзы дарыясынын дельта аймагында бруцеллездун патогендик байкоо жүргүзүү жана тобокелдигин баалоо үчүн жаңы баштапкы маалыматтарды берет.

 

Кагаз маалыматы:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Кытайдын Чжэцзян провинциясындагы жети Brucella abortus штаммын аныктоо жана филогенетикалык талдоо. Cellullar and Infection Microbiology журналынын чек аралары, 16, 1758965.

 

 


Жарыяланган убактысы: 2026-жылдын 10-июну